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微生物研究必備:Cytoscape繪制網絡圖(四)
Cytoscape是一個專用于互作網絡數據可視化的軟件。上幾次,我們介紹了Cytoscape軟件下載和安裝、數據導入技巧、節點屬性設置方法。接下來,我們介紹網絡圖中線屬性設置方法。 READ MORE > -
強大的文本搜索工具,就選Grep!
Grep
Grep是Global search Regular Expression and Print out the line的縮寫。grep是Linux中最常使用的命令之一,是一個功能強大的文本搜索工具,它可以使用正則表達式搜索文本并打印匹配行。 READ MORE > -
掌握customLayout包,拼圖so easy!
R語言中customLayout包也許能幫到你喲。它可以把幾張不同的圖拼在一張圖上,用簡單容易的操作命令來完成繁瑣的圖片布局設置。 READ MORE > -
轉錄組分析深度挖掘-TCGA數據庫(二)
緊接上回課程分享,小銳繼續分享另外兩種的數據下載方法:python腳本法下載、R腳本法下載。 READ MORE > -
轉錄組分析深度挖掘-TCGA數據庫(一)
很多小白表示TCGA好深奧,找不到下載地址的,看不懂數據格式。今天小銳就從零開始,講解TCGA數據庫和下載方法。在下載數據之前,小銳閱讀了多篇文獻,總結如下的利用公開數據庫分析的思路。 READ MORE > -
Linux三劍客之-sed使用
sed原理:sed以文本的行為單位進行處理,一次處理一行內容。首先sed把當前處理的行存儲在臨時緩沖區中(稱為模式空間pattern space),接著處理緩沖區中的行,處理完成后,把緩沖區的內容送往屏幕。sed處理... READ MORE > -
如何選擇合適的配色方案?R語言調色板了解一下!
用R語言可視化數據時,不同的數據通常需要不同的配色方案。合適的顏色不但能夠使得圖片更加美觀,也能更好地展示數據之間的關系。 READ MORE >